About the Journal
Current Issue
Past Issues
In Silico and in Vitro Studies of Fluorinated Chroman-2-Carboxilic Acid Derivatives as an Anti-tubercular Agent
Khushal M. Kapadiya1, Yashwantsinh S. Jadeja2, Avishek Banik3, Ranjan C. Khunt2
1 Department of Chemistry, RK University, Rajkot, Gujarat, India
2 Department of Chemistry, Saurashtra University, Rajkot, Gujarat, India
3 Department of Microbiology, RK University, Rajkot, Gujarat, India
doi: 10.2478/folmed-2018-0034
Background: Despite the use of traditional method, Ugi reaction currently is a well-established multicomponent reaction. Chromane motif itself possesses a variety of biological functions. In order to improve its anti-tubercular activity, it is necessary to modify it accordingly.
Aim: To ensure relation between in silico and in vitro study, we have carried out in vitro screening against H37Rv anti-tubercular agent.
Materials and methods: Ugi four-component condensation (U-4CCRs) between 6-fl uorochroman-2-carboxylic acid, various aryl aldehyde, 3,4,5-trimethoxy amine and tert-butyl isocyanide, gave N-((tert-butylcarbamoyl)(4-substitutedphenyl) methyl)-6-fl uoro-N-(3,4,5-trimethoxyphenyl) chroman-2-carboxamide. The molecular level insight of all compounds was carried out by molecular docking study against the receptor tyrosine phosphatase PtpB. All these newly synthesized compounds were screened for their anti-microbial activity against Mycobacterium tuberculosis H37Rv to determine the MIC, IC50 and IC90 of the compound.
Results: The compound 5d also shows large hydrophobic surface contact on the face of the α7–α8 (Ile 207, Phe 211, Met 206, Ile203, Phe161, Phe80, Met126, Tyr130, Val231 and Leu101) that lines one side of the entrance to the active site of the receptor. The compound 5d bind with tyrosine phosphatase PtpB with predicted docking geometric score of 4664, whereas a score of rifampicin was 6586 determined.
Conclusion: From the docking studies, compound 5d, was considered to be the potent inhibitor, which gave strong supportive coordinate with the in vitro study. It is highly active against H37Rv, having MIC and IC50 value of was 70 μM and 53 μM respectively in in vitro study.
РЕЗЮМЕ
Введение: Вопреки использованию традиционных методов, реакция Уги в настоящее время является хорошо установленной многокомпонентной ре- акцией. Сам по себе хромановый мотив имеет множество биологических функций. Чтобы улучшить его противотуберкулёзную активность, необходи- мо соответствующим образом её модифицировать.
Цель: С целью установить связь между In silico и in vitro исследованием мы провели скрининг in vitro противотуберкулёзного агента H37Rv.
Материалы и методы: Четырёх-компонентная конденсация по методу Уги (U-4CCRs) между 6-фторхроманом-2-карбоновой кислотой, другими арильны- ми альдегидами, 3,4,5-триметоксифенилом амина и трет-бутил изоцианидом дала N - ((трет-бутилкарбамоил) (4-фенилзамещённый) метил)-6-фтор-N-(3,4,5- триметоксифенил) хроман-2-карбоксамид. Определение молекулярного уровня всех составляющих проводилось путём молекулярной стыковки с рецепторной тирозинфосфатазой PtpB. Все эти новосинтезированные соединения прошли скрининг на антимикробную активность микобактерий туберкулёза H37Rv, для определения MИК (минимальной ингибирующей концентрации), ИК50 и ИК90 ингредиентов.
Результаты: Ингредиент 5d также показал большую гидрофобную поверх- ность контакта α7-α8 (Ile 207, Phe 211, Met 206, Ile203, Phe161, Phe80, Met126, Tyr130, Val231 и Leu101), которые охватывают одну сторону входа активной части рецептора. Компонент 5d связывается с тирозинфосфатазой PtpB с прогнозированной докинг геометрической стыковкой 4664, тогда как сты- ковка рифампицина составляет 6586.
Вывод: Согласно докинг исследованию ингредиент 5d оказался сильным ингибитором, что в основном совпало с результатами исследования in vitro. Он очень активен против H37Rv, причём значения MИК и ИК50 соответствен- но составляют 70 μM и 53 μM исследования in vitro.
